用Graphpad绘制受试者ROC曲线教程

在生物标志物模型的分析中，还有一种常用的分析方法:ROC曲线分析。如下图所示，ROC曲线也是这类文献中常见的分析图表。结合临床数据，可以验证基因或模型作为疾病诊断和预后的标志。

那么如何用Graphpad绘制ROC曲线呢？下面以下图为例，一步一步演示。

1?数据准备

绘制ROC曲线需要生存状态和基因表达，数据整理成表格。样本文件样本数据。xlsx。

(1)患者:患者号；(2)状态:生存状态，其中0表示生存，1表示死亡；(3)表达:基因的表达(或模型的风险评分)。

2?使用Graphpad进行ROC分析

接下来，打开Graphpad，选择Column，然后单击Create。

将Excel中ROC的数据复制到Graphpad。

在分析中点击分析，在列分析中选择ROC曲线，点击确定。

在参数:ROC曲线中选择身份线(是否画参考线，AUC=0.5)，点击确定。

在结果中点击数据1的ROC中的面积，其中ROC曲线下的面积就是我们需要的AUC值。

3?绘制ROC曲线

点击ROC曲线:图表中数据1的ROC。

双击坐标轴修改相关参数。单击框架和原点，选择正方形大小，同时修改宽度和高度。在框架样式中选择普通框架。

单击X轴取消选择自动确定范围和间隔。修改最小值(x轴最小值)、最大值(x轴最大值)和主要刻度间隔。单击左轴修改相同的参数。

双击绘图区，选择Data1的ROC:ROC曲线:数据集中的灵敏度%，取消选择显示符号(显示关键点)、颜色、样式(将类型改为折线)、显示图例等参数；将数据集修改为Data1的ROC:ROC曲线:Indentity %，修改相同的参数。

修改X轴和Y轴标题，将图例调整到合适的位置，ROC图就画出来了。

结果还是很好看的吧？